Michiru Kaiou es una estudiante de dieciséis años que asiste al insituto, siendo una belleza y un prodigio del violín y la pintura a su corta edad, no es de extrañar que la joven sea popular entre los varones. No obstante, la joven promesa guarda un secreto y es que se encuentra secretamente enamorada de Haruka Tenou, la estrella del equipo de atletismo, una rubia carismática y de belleza singular, muy admirada entre las colegialas.

Sin embargo la apaciguada vida de Michiru se verá interrumpida después de encontrar a Luna, una gata negra misteriosa que le otorgará una misión y un nuevo poder, haciéndola despertar como la guerrero Neptuno.

Ahora deberá proteger La Tierra de unos seres extraños, provenientes del exterior del Sistema solar, los cuales pretenden robar la energía de los humanos con fines perversos.

Paralelamente la vida de Haruka Tenou dará un giro radical tras conocer a Artemis, un gato blanco que le dará el poder de la guardiana del planeta del viento, para combatir junto a Neptuno. A pesar de todo, Haruka se ha enamorado de la guerrero Neptuno, aunque desconoce su verdadera identidad, mientras que Michiru permanecee enamorada de Haruka, aunque aún no sabe que ella es en realidad guerrero Urano.